指导和推进全州卫生应急体系和能力建设，组织协调传染病疫情应对工作;承担各类突发公共事件的紧急医学救援工作，组织编制卫生应急专项预案，承担预案演练的组织实施和指导监督工作，发布突发公共卫生事件应急处置信息；指导开展紧急医学救援基地建设；拟订重大疾病、慢性病防控管理政策规范并监督实施;负责监督指导自治州卫生健康系统的维稳、安全生产工作；负责自治州重要会议和重大活动的医疗卫生保障工作。